Проект 4D Nucleome создает карту трехмерной архитектуры генома
Программа 4D Nucleome Национальных институтов здравоохранения опубликовала знаковую коллекцию исследований в Science и Science Advances на этой неделе, предоставив наиболее детальную карту организации генома человека в трехмерном пространстве и того, как эта архитектура меняется со временем. В исследовании, в котором участвовали более трех десятков лабораторий из восьми стран, выявлено более 140 000 петель взаимодействия между генами и удаленными регуляторными элементами. Статья на обложке Science описывает, как свернутая структура генома — его «четвертое измерение» ядерной организации — формирует идентичность клетки, меняется в процессе развития и старения и нарушается при заболеваниях. Консорциум объединил данные более чем дюжины экспериментальных методов, включая Hi-C, Micro-C, SPRITE и GAM. «Это все равно что перейти от плоской карты мира к глобусу, показывающему, как континенты на самом деле связаны под поверхностью», — сказал один из исследователей. «Мы знали, что петли ДНК важны для регуляции генов, но теперь мы видим полную схему проводки». Результаты имеют глубокие последствия для понимания болезней, связанных с неправильным сворачиванием генома, включая некоторые виды рака и нарушения развития. Данные доступны через Портал данных 4DN.