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研究发现,普通人基因组携带430万至530万个变异

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单个人类基因组并非参考序列的近似副本加上几处笔误。根据迄今最大规模的普通人基因组描述工作,它与参考序列在430万至530万个位点上存在差异。

埃克塞特大学医学院的研究人员利用两个生物银行——英国生物银行和美国“我们所有人”项目——中近90万成年人的全基因组序列构建了这一图景。研究结果发表在《基因组医学》上。

变异才是常态

这数百万个差异中的大多数在人群中很常见,位于基因之外,不太可能对健康产生任何可测量的影响。一个人只有约1.5%的变异是罕见的。

普通人携带约229个被预测会破坏基因功能的变异,不过其中只有约72%的判定是高置信度的。在与遗传性单基因疾病相关的基因中,典型基因组携带1至3个被ClinVar数据库归类为致病或可能致病的变异。大多数是隐性疾病的单拷贝,这使得该人是健康的携带者而非患者。另有约50个是意义不明的变异,科学尚无法说明这种改变会产生什么影响。

新突变与父亲年龄

利用2334个亲子三联体,研究团队估计每个人出生时携带约61个新突变,另有约2个在发育早期产生。在可追溯的新突变中,75%至80%来自父亲。父亲受孕年龄每增加一岁,与约1.2个额外新突变相关,而母亲年龄每增加一岁约为0.4个。

对筛查的意义

随着基因检测从诊断罕见病转向预测常见病,这些数字变得重要。多基因风险评分综合了许多微小效应,将普通人置于28种常见疾病中约3种的最高10%风险区间。如果没有正常状态的基线,高分很容易被误读。

一个偏差尤为突出。非洲血统的人平均携带约多100万个变异,部分原因是参考基因组主要来自欧洲血统的人。随着筛查的扩大,这一差距成为技术问题,而不仅仅是历史问题。

来源: Sci.News