Tek bir insan genomu, referans dizinin birkaç yazım hatası içeren neredeyse bir kopyası değil. Sıradan bir genomun neye benzediğini tanımlamaya yönelik şimdiye kadarki en büyük çabaya göre, referanstan 4,3 ila 5,3 milyon noktada farklılaşıyor.
Exeter Üniversitesi Tıp Fakültesi'ndeki araştırmacılar bu resmi iki biyobankadaki, UK Biobank ve ABD All of Us programındaki yaklaşık 900.000 yetişkinin tam genom dizilerinden oluşturdu. Sonuçlar Genome Medicine dergisinde yayımlandı.
Varyasyon normal durumdur
Bu milyonlarca farkın çoğu popülasyonda yaygın, genlerin dışında yer alıyor ve sağlık üzerinde ölçülebilir bir etkiye sahip olması olası değil. Bir bireyin varyantlarının yalnızca yaklaşık yüzde 1,5'i nadir.
Ortalama bir kişi, bir genin işlevini bozması öngörülen yaklaşık 229 varyant taşıyor, ancak bu çağrıların yalnızca yaklaşık yüzde 72'si yüksek güvenilirlikte. Kalıtsal tek gen hastalıklarıyla bağlantılı genler arasında tipik genom, ClinVar veritabanının patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı bir ila üç varyant barındırıyor. Çoğu çekinik hastalıkların tek kopyası, bu da kişiyi hasta değil sağlıklı taşıyıcı yapıyor. Yaklaşık 50 tanesi daha belirsiz öneme sahip varyantlar; bilim değişikliğin ne yaptığını henüz söyleyemiyor.
Yeni mutasyonlar ve babanın yaşı
2.334 ebeveyn-çocuk üçlüsünü kullanan ekip, her kişinin yaklaşık 61 yeni mutasyonla, ayrıca gelişimin erken döneminde ortaya çıkan yaklaşık iki mutasyonla doğduğunu tahmin etti. İzlenebilir yeni mutasyonların yüzde 75 ila 80'i babadan geldi. Döllenme sırasında babalık yaşındaki her ek yıl, yaklaşık 1,2 ek yeni mutasyonla ilişkilendirildi; annelik yaşındaki her yıl için bu sayı yaklaşık 0,4.
Tarama için anlamı
Genetik testler nadir hastalıkları teşhis etmekten yaygın hastalıkları öngörmeye geçerken bu sayılar önem kazanıyor. Birçok küçük etkiyi birleştiren poligenik risk skorları, ortalama kişiyi 28 yaygın durumdan yaklaşık üçü için riskin en üst yüzde 10'una yerleştirdi. Normalin neye benzediğine dair bir temel olmadan yüksek bir skoru yanlış okumak kolay.
Öne çıkan bir yanlılık var. Afrika kökenli kişiler ortalama olarak yaklaşık bir milyon daha fazla varyant taşıyordu; bunun kısmi nedeni referans genomun büyük ölçüde Avrupa kökenli kişilerden oluşturulması. Tarama genişledikçe bu fark yalnızca tarihsel değil teknik bir sorun haline geliyor.