จีโนมมนุษย์หนึ่งชุดไม่ใช่สำเนาใกล้เคียงของลำดับอ้างอิงที่มีการพิมพ์ผิดเพียงไม่กี่จุด แต่แตกต่างจากลำดับอ้างอิงที่ 4.3 ถึง 5.3 ล้านตำแหน่ง ตามความพยายามครั้งใหญ่ที่สุดเท่าที่เคยมีมาในการอธิบายว่าจีโนมธรรมดาหน้าตาเป็นอย่างไร
นักวิจัยจากมหาวิทยาลัยเอ็กซิเตอร์ เมดิคอล สคูล สร้างภาพนี้จากลำดับจีโนมทั้งชุดของผู้ใหญ่เกือบ 900,000 คนในสองธนาคารชีวภาพ คือ UK Biobank และโครงการ All of Us ของสหรัฐฯ ผลการศึกษาตีพิมพ์ในวารสาร Genome Medicine
ความแปรผันคือกรณีปกติ
ความแตกต่างหลายล้านตำแหน่งส่วนใหญ่พบได้ทั่วไปในประชากร อยู่นอกยีน และไม่น่าจะมีผล measurable ต่อสุขภาพ มีเพียงประมาณ 1.5 เปอร์เซ็นต์ของความแปรผันของแต่ละบุคคลที่เป็นความแปรผันหายาก
คนทั่วไปมีความแปรผันประมาณ 229 ตำแหน่งที่คาดว่าจะรบกวนการทำงานของยีน แม้ว่ามีเพียงประมาณ 72 เปอร์เซ็นต์ของการคาดการณ์เหล่านั้นที่มีความเชื่อมั่นสูง ในบรรดายีนที่เชื่อมโยงกับโรคที่ถ่ายทอดทางพันธุกรรมแบบยีนเดียว จีโนมทั่วไปมีหนึ่งถึงสามความแปรผันที่ฐานข้อมูล ClinVar จัดเป็นก่อโรคหรือน่าจะก่อโรค ส่วนใหญ่เป็นสำเนาเดียวของภาวะถอย ซึ่งทำให้บุคคลเป็นพาหะที่มีสุขภาพดีมากกว่าผู้ป่วย อีกประมาณ 50 ตำแหน่งเป็นความแปรผันที่มีนัยสำคัญไม่ชัดเจน ซึ่งวิทยาศาสตร์ยังบอกไม่ได้ว่าการเปลี่ยนแปลงนั้นทำอะไร
การกลายพันธุ์ใหม่และอายุของบิดา
การใช้กลุ่มพ่อแม่และลูก 2,334 กลุ่ม ทีมประเมินว่าแต่ละคนเกิดมาพร้อมการกลายพันธุ์ใหม่ประมาณ 61 ตำแหน่ง บวกอีกประมาณสองตำแหน่งที่เกิดขึ้นในช่วงต้นของการพัฒนา ระหว่าง 75 ถึง 80 เปอร์เซ็นต์ของการกลายพันธุ์ใหม่ที่ตรวจสอบย้อนกลับได้มาจากบิดา อายุของบิดาที่เพิ่มขึ้นแต่ละปีขณะปฏิสนธิเชื่อมโยงกับการกลายพันธุ์ใหม่เพิ่มขึ้นประมาณ 1.2 ตำแหน่ง เทียบกับประมาณ 0.4 ตำแหน่งต่ออายุของมารดาแต่ละปี
ความหมายต่อการคัดกรอง
ตัวเลขเหล่านี้สำคัญเมื่อการทดสอบทางพันธุกรรมเคลื่อนจากการวินิจฉัยโรคหายากไปสู่การทำนายโรคทั่วไป คะแนนความเสี่ยงแบบพอลิเจนิกซึ่งรวมผลเล็ก ๆ หลายอย่างเข้าด้วยกัน จัดให้คนทั่วไปอยู่ในกลุ่ม 10 เปอร์เซ็นต์ที่มีความเสี่ยงสูงสุดสำหรับประมาณสามใน 28 ภาวะทั่วไป หากไม่มีค่าฐานว่าปกติหน้าตาเป็นอย่างไร คะแนนสูงก็อ่านผิดได้ง่าย
อคติหนึ่งเด่นชัด ผู้ที่มีบรรพบุรุษแอฟริกันมีความแปรผันมากกว่าประมาณหนึ่งล้านตำแหน่งโดยเฉลี่ย ส่วนหนึ่งเพราะจีโนมอ้างอิงสร้างจากคนเชื้อสายยุโรปเป็นส่วนใหญ่ เมื่อการคัดกรองขยายออก ช่องว่างนั้นกลายเป็นปัญหาทางเทคนิค ไม่ใช่แค่เรื่องทางประวัติศาสตร์