4D Nükleom Projesi İnsan Genomunun 3D Mimarisini Haritalıyor
Ulusal Sağlık Enstitüleri'nin (NIH) 4D Nükleom Programı, bu hafta Science ve Science Advances dergilerinde bir dizi çığır açan çalışma yayınlayarak insan genomunun üç boyutlu uzayda nasıl organize olduğu ve bu mimarinin zaman içinde nasıl değiştiğine dair şimdiye kadarki en ayrıntılı haritayı sundu. Sekiz ülkedeki üç düzineden fazla laboratuvarı içeren araştırma, genler ile uzak düzenleyici bölgeler arasında 140.000'den fazla döngü etkileşimi tanımlıyor. Science dergisindeki kapak yazısı, genomun katlanmış yapısının - çekirdek organizasyonunun "dördüncü boyutu" - hücre kimliğini nasıl şekillendirdiğini, gelişim ve yaşlanma boyunca nasıl değiştiğini ve hastalıkta nasıl bozulduğunu açıklıyor. Konsorsiyum, Hi-C, Micro-C, SPRITE ve GAM dahil bir düzineden fazla deneysel teknikten gelen verileri entegre etti. Bir araştırmacı, "Bu, dünyanın düz bir haritasından kıtaların yüzeyin altında nasıl bağlandığını gösteren bir küreye geçmek gibi. DNA döngülerinin gen düzenlemesi için önemli olduğunu biliyorduk, ama şimdi tam kablolama şemasını görebiliyoruz" dedi. Bulguların, belirli kanserler ve gelişimsel bozukluklar dahil olmak üzere genom katlanma bozukluklarıyla bağlantılı hastalıkları anlamak için derin etkileri var. Veriler, 4DN Veri Portalı aracılığıyla herkese açık olarak sunuluyor.