الجينوم البشري الواحد ليس نسخة قريبة من التسلسل المرجعي مع بعض الأخطاء المطبعية. فهو يختلف عنه في 4.3 إلى 5.3 مليون موقع، وفقاً لأكبر جهد حتى الآن لوصف شكل الجينوم العادي.
وبنى الباحثون في كلية الطب بجامعة إكسيتر الصورة من تسلسلات الجينوم الكامل لنحو 900 ألف بالغ في بنكين حيويين، هما البنك الحيوي البريطاني وبرنامج "الجميع منا" الأمريكي. وتظهر النتائج في دورية "جينوم ميديسن".
التباين هو الحالة الطبيعية
معظم تلك الملايين من الاختلافات شائعة في السكان، وتقع خارج الجينات، ومن غير المرجح أن يكون لها أي تأثير قابل للقياس على الصحة. ونحو 1.5 في المئة فقط من تحورات الفرد نادرة.
ويحمل الشخص المتوسط نحو 229 تحوراً يُتوقع أن تعطل وظيفة جين، رغم أن نحو 72 في المئة فقط من تلك التقديرات عالية الثقة. وبين الجينات المرتبطة بأمراض أحادية الجين موروثة، يحمل الجينوم النموذجي من واحد إلى ثلاثة تحورات تصنفها قاعدة بيانات "كلين فار" ممرضة أو مرجحة المرضية. ومعظمها نسخ مفردة من حالات متنحية، ما يجعل الشخص حاملاً سليماً لا مريضاً. ونحو 50 أخرى تحورات ذات دلالة غير مؤكدة، حيث لا يستطيع العلم بعد تحديد ما يفعله التغيير.
طفرات جديدة وعمر الأب
باستخدام 2334 ثلاثياً من الوالدين والطفل، قدّر الفريق أن كل شخص يولد بنحو 61 طفرة جديدة، إضافة إلى نحو طفرتين تنشآن مبكراً في النمو. وجاء ما بين 75 و80 في المئة من الطفرات الجديدة القابلة للتتبع من الأب. وارتبطت كل سنة إضافية من عمر الأب عند الإنجاب بنحو 1.2 طفرة جديدة إضافية، مقابل نحو 0.4 لكل سنة من عمر الأم.
ماذا يعني ذلك للفحص
تكتسب الأرقام أهمية مع انتقال الاختبارات الجينية من تشخيص الأمراض النادرة إلى التنبؤ بالشائعة. فقد وضعت درجات المخاطر متعددة الجينات، التي تجمع تأثيرات صغيرة كثيرة، الشخص المتوسط في أعلى 10 في المئة من المخاطر لنحو ثلاث من 28 حالة شائعة. وبدون خط أساس لما يبدو عليه الطبيعي، يسهل إساءة قراءة درجة عالية.
ويبرز تحيز واحد. فالأشخاص من أصل أفريقي حملوا نحو مليون تحور إضافي في المتوسط، جزئياً لأن الجينوم المرجعي بُني في معظمه من أشخاص من أصل أوروبي. ومع توسع الفحص، تصبح تلك الفجوة مشكلة تقنية، لا مجرد مشكلة تاريخية.