인간 게놈 하나는 참조 서열과 몇 군데 오타만 있는 거의 같은 사본이 아니다. 평범한 게놈이 어떤 모습인지 기술하려는 역대 최대 규모의 연구에 따르면, 인간 게놈은 참조 서열과 430만~530만 개 지점에서 다르다.
엑서터 의과대학 연구진은 영국 바이오뱅크와 미국 '올 오브 어스' 프로그램 두 바이오뱅크의 성인 약 90만 명 전장 유전체 서열로 이 그림을 완성했다. 결과는 '게놈 메디신'에 실렸다.
변이는 정상적인 경우
수백만 개 차이 중 대부분은 인구 집단에서 흔하고 유전자 밖에 위치하며 건강에 측정 가능한 영향을 줄 가능성이 낮다. 개인의 변이 중 희귀한 것은 약 1.5%에 불과하다.
평균적인 사람은 유전자 기능을 방해할 것으로 예측되는 변이를 약 229개 보유하지만, 그중 고신뢰도 판정은 약 72%에 그친다. 유전성 단일유전자 질환과 연관된 유전자에서 전형적인 게놈은 ClinVar 데이터베이스가 병원성 또는 병원성 가능으로 분류한 변이를 1~3개 보유한다. 대부분은 열성 질환의 단일 사본으로, 해당 개인을 환자가 아닌 건강한 보인자로 만든다. 추가로 약 50개는 그 변화가 무엇을 하는지 과학이 아직 말할 수 없는 불확실한 의미의 변이다.
새 돌연변이와 아버지의 나이
2,334쌍의 부모-자녀 삼인조를 활용해 연구진은 각 개인이 약 61개의 새 돌연변이를 갖고 태어나며, 발달 초기에 생기는 약 2개가 더해진다고 추정했다. 추적 가능한 새 돌연변이의 75~80%는 아버지로부터 왔다. 임신 시 아버지의 나이가 1년 늘어날 때마다 새 돌연변이가 약 1.2개 더 늘어난 반면, 어머니의 나이는 1년당 약 0.4개였다.
선별검사에 대한 의미
유전자 검사가 희귀질환 진단에서 흔한 질환 예측으로 이동하면서 이 수치들은 중요해진다. 많은 작은 효과를 결합하는 다유전자 위험 점수는 평균적인 사람을 28개 흔한 질환 중 약 3개에서 위험 상위 10%에 놓았다. 정상이 어떤 모습인지에 대한 기준선이 없으면 높은 점수는 잘못 읽기 쉽다.
두드러지는 편향이 하나 있다. 아프리카 혈통의 사람들은 평균적으로 약 100만 개 더 많은 변이를 보유했는데, 이는 참조 게놈이 주로 유럽 혈통에서 만들어졌기 때문이다. 선별검사가 확대될수록 이 격차는 역사적 문제가 아니라 기술적 문제가 된다.